生信分析主要包括兩大類:
一類是對(duì)DNA、RNA、蛋白質(zhì)和代謝物進(jìn)行定量和定性分析;另一類是對(duì)復(fù)雜的生物信息數(shù)據(jù)進(jìn)行圖形化展示、可視化分析以及機(jī)器學(xué)習(xí)方面的應(yīng)用。
在DNA、RNA、蛋白質(zhì)和代謝物定量分析方面,常用的方法有PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))、qPCR(定量PCR)、NGS(測(cè)序)、微衛(wèi)星遺傳圖譜分析、RAPD(隨機(jī)引物序列擴(kuò)增多樣性)。在復(fù)雜生物信息數(shù)據(jù)的可視化方面,常用的方法有 UMLS(Unified Medical Language System) 、Conceptual Graphs(CGs) 和Hierarchical display 等。而在機(jī)器學(xué)習(xí)方面應(yīng)用的主要方法有SVM(Support VectorMachine) 和C4.5 decision tree learning algorithm 等等。
生信分析的應(yīng)用
生信分析是通過(guò)計(jì)算機(jī)對(duì)生物信息進(jìn)行分析的方法。這些方法可以用來(lái)獲得關(guān)于生物體的重要信息,例如基因組學(xué)、蛋白質(zhì) 組學(xué)、代謝組學(xué)和微生物組學(xué)。生信分析已經(jīng)成為了生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中不可或缺的一部分。它不僅可以用來(lái)研究遺傳學(xué)問(wèn)題,還可以幫助我們了解人體和微生物體內(nèi)的各種過(guò)程。目前,生信分析主要應(yīng)用于兩個(gè)領(lǐng)域:醫(yī)學(xué)和農(nóng)業(yè)。在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,生信分析可以用來(lái)診斷和治療各種疾病。通過(guò)對(duì)人體基因組的分析,我們可以找到導(dǎo)致各種遺傳性疾病的基 因,并為患者定制個(gè)性化的治療方案。 在農(nóng)業(yè)領(lǐng)域,生信分析可以用來(lái)優(yōu)化作物的產(chǎn)量。通過(guò)對(duì)作物基因的分析,我們可以找到能夠幫助作物適應(yīng)不同氣候條件的 基因,并將其遺傳到下一代作物中。隨著生信分析方法日益成熟,它將在越來(lái)越多領(lǐng)域得到應(yīng)用,幫助我們了解人體、微生物體內(nèi)各個(gè)復(fù)雜過(guò)程,并控制它們。